Die Kirchengemeinde Bad Holzhausen arbeitet mit an der Partnerschaft des Kirchenkreises Lübbecke mit dem Kirchenkreis Sibolangit der GBKP (Protestantische Kirche der Karo Batak) auf der indonesischen Insel Sumatra.
Ferner pflegt die Kirchengemeinde Bad Holzhausen eine Partnerschaft mit der Kirchengemeinde Zechliner Land in Brandenburg.
Außerdem haben beide Gemeinden Patenkinder in aller Welt über die Kindernothilfe, die sie mit finanziellen Mitteln und Spenden unterstützen.
Der Weltgebetstag und seine Vorbereitung ist in beiden Gemeinden fester Bestandteil der jährlich wiederkehrenden Veranstaltungen.